Préparation et Envoi avec zenodo-upload.py

Le script zenodo-upload.py du dépôt Zenodo Tools est conçu pour automatiser l'envoi d'une session Seatizen locale vers Zenodo. L'opération nécessite la préparation de plusieurs fichiers de métadonnées.

Zenodo Upload est disponible sur le dépôt GitHub suivant : https://github.com/SeatizenDOI/zenodo-tools

Étape 1 : Fichiers Locaux Requis

Pour commencer l'envoi, la session doit être présente en local et vous devez préparer deux fichiers CSV pour le suivi des métadonnées et des contributeurs.

1. Fichier de Suivi de Session (suivi_session.csv)

Ce fichier CSV sert à définir les informations de base de chaque session à envoyer.

Tous les champs que zenodo accepte sont ici https://developers.zenodo.org/#representation au niveau de contributors. 

session_name,Creators,DataManager,DataCollector,ProjectMember
20150611_REU-St-Gilles_scuba,"PM, TB, MR, LM",VI,,,
20150615_REU-La-Saline_scuba,"PM, TB, MR, LM",VI,,,
20150616_REU-La-Saline_scuba,"PM, TB, MR, LM",VI,,,
20150617_REU-St-Leu_scuba   ,"PM, TB, MR, LM",VI,,,
20150619_REU-St-Gilles_scuba,"PM, TB, MR, LM",VI,,,

Exemple de structure suivi_session.csv

2. Fichier des Contributeurs (contributors.csv)

Ce fichier associe les initiales (utilisées dans le Fichier de Suivi) aux noms complets et aux affiliés des personnes. 

id,name,affiliation,orcid
AB,Alexandre Boyer,"UMR Marbec, IRD, La Réunion", France,0009-0002-2787-1044
AJ,Alexis Joly,"INRIA Zenith, Montpellier, France",0000-0002-2161-9940
AG,Andrea Goharzadeh,"Ifremer DOI, La Réunion, France",

Exemple de structure contributors.csv

Étape 2 : Lier les Données via metadata.json

Les deux fichiers CSV (Suivi de Session et Contributeurs) doivent être liés ensemble via le fichier de configuration principal du script : metadata.json.

Ce fichier JSON est l'endroit où vous spécifiez les chemins d'accès à vos fichiers CSV et d'autres paramètres pour le processus d'upload.

Exemple de structure metadata.json

Étape 3 : Logique Interne du Script

Le code de zenodo-upload.py est conçu pour automatiser certaines déterminations de métadonnées basées sur le contenu de la session :

  • Détermination de la Plateforme d'Acquisition : Le script analyse automatiquement le type de plateforme utilisée (par exemple, UVC, ASV, UVC) depuis le nom de la session.
  • Note Spéciale UVC : Les sessions UVC sont souvent traitées via une classe spéciale, notamment pour les sessions d'Amoros.

  • Note Spéciale Scuba : L'implémentation pour Scuba peut être intégrée différemment ou dans une logique spécifique, potentiellement classée avec UVC.

  • Métadonnée ISO 19115 :

  • Attention : La génération de la métadonnée ISO 19115 est actuellement configurée pour être spécifique aux exigences d'Ifremer.
  • Si d'autres utilisateurs ou institutions souhaitent utiliser ce script, il faudra probablement modifier les noms ou la structure utilisée pour cette norme afin de s'adapter à leurs propres standards.